产品货号:
BTN14-24820
中文名称:
诺如病毒G2型荧光定量RT-PCR试剂盒(染料法)
英文名称:
Norwalk Viruses G2 SYBR RT-qPCR Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本制品是基于染料法RT-qPCR技术开发的用于诺如病毒研究检测诺如病毒的试剂盒。
保存:-20℃,有效期一年。
一、稀释阳性对照
以101~106这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行。
二、样品RNA的制备
三、设置RT-PCR反应
四、数据处理
相关搜索:诺如病毒G2型荧光定量RT-PCR试剂盒(染料法),诺如病毒G2型检测,Norwalk Viruses G2 SYBR RT-qPCR Kit
诺如病毒(Norwalk Viruses,NV)是人类杯状病毒科(Human Calicivirus,HuCV)中诺如病毒(Norovirus,NV)属的一种病毒。NV是引起儿童和成人非细菌性急性胃肠炎的重要病因,主要通过粪-口途径传播,与饮用水和食物尤其是贝类的污染密切相关。NV感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,感染对象主要是成人和学龄儿童,寒冷季节呈现高发。美国每年在所有的非细菌性腹泻暴发中,60~90%是由NV引起。荷兰、英国、日本澳大利亚等发达国家也都有类似结果。在中国5岁以下腹泻儿童中,NV检出率为15%左右,血清抗体水平调查表明中国人群中诺如病毒的感染亦十分普遍。该病毒是一组形态相似、抗原性略有不同的RNA病毒,分为G(I-V)五型,感染人的有GI、GII和GIV型,其中以GII型最为常见。NV是引起儿童和成人非细菌性急性胃肠炎的重要病因,没有疫苗和特效药物,因此灵敏快捷的诊断产品NV-2型病毒具有重要的意义。
- 一站式,用于不需要单独准备每种成分,只需要提供RNA样品。
- 基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10~100倍,可以达到至少100拷贝/反应。
- 根据诺如病毒G2型的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性,不会跟其它生物的RNA发生交叉反应。
- 使用一管式qRT-PCR技术,RT和PCR两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。
- 本制品既可用于定性检测,也可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少有5个数量级。
- 本制品足够50次20μL体系的RT-PCR反应。
- 只能用于科研,不能用于临床。
组分 | 规格 |
2×SYBR qRT-PCR缓冲液 | 500μL |
10×SYBR qRT-PCR酶混合液 | 100μL |
荧光PCR专用模板稀释液 | 1mL |
诺如病毒G2型qRT-PCR引物干粉 | 50T |
诺如病毒G2型qRT-PCR阳性对照(1×107拷贝/μL) | 50μL |
保存:-20℃,有效期一年。
- 引物探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入110μL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
- 阳性对照需要单独放置。
一、稀释阳性对照
以101~106这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行。
- 标记6个离心管,分别为6、5、4、3、2、1。用带芯枪头分别加入45μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
- 换枪头,在6号管中加入5μL 1×107拷贝/μL的阳性对照,充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
- 换枪头,在5号管中加入5μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
- 换枪头,在4号管中加入5μL 1×105拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×104拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
- 重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
- 如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上得到的阳性对照梯度稀释液中的第4号(浓度为1×104拷贝/μL,10μL相当于1万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的样本起始体积一样)。可以用水作为制备的阴性对照。
- 用自选方法纯化N+2个样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒样品RNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、设置RT-PCR反应
- 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
- 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分 样品管
N+2个RT-PCR
阴性对照RT-PCR阳性
对照(1~6管)2×SYBR qRT-PCR缓冲液 10μL 10μL 各10μL 诺如病毒G2型qRT-PCR引物混合液 2μL 2μL 各2μL N+2个RNA模板 6μL 不加 不加 自备超纯水 不加 6μL 不加 6个阳性对照稀释液 不加 不加 各6μL 10×SYBR qRT-PCR酶混合液 2μL 2μL 2μL - 上机后按下面参数进行RT-PCR。
注意:循环次数最好不要超过35次。过程 温度 时间 RT(逆转录) 50℃ 30分钟 预变性 95℃ 2分钟 PCR反应
(35个循环)95℃ 15秒 60℃ 15秒(采集SYBR通道的荧光信号) 72℃ 15秒 按仪器预设程序进行溶解曲线分析
四、数据处理
- 通过溶解曲线分析的结果排除无效数据。有Ct值,但Tm值跟阳性对照Tm不一样的样品(包括对照和待测样品),归为假阳性,数据无效,不予以分析。Tm跟阳性对照Tm一致的,为有效Ct。
- 如果两种阴性对照的溶解曲线所得Tm值跟阳性对照的Tm值一样,说明环境或试剂可能有过去的qRT-PCR扩增产物污染,则此次实验无效,需要解决污染问题再进行实验。
- 如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和qRT-PCR阴性对照)是假阳性,可以继续分析其它样品有效数据。
- 对定量检测,以阳性对照样品的浓度的log值为横轴,以有效Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的有效Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再换算出待测样品的RNA浓度。
- 对定性检测,则有有效Ct值的为阳性,无有效Ct值的为阴性。
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